理想的無(wú)菌操作室應(yīng)劃為三部分：
●更衣室：供更換衣服、鞋子及穿戴帽子和口罩。
●緩沖間：位于更衣間與操作間之間。
目的是為了保證操作間的無(wú)菌環(huán)境，同時(shí)可放置恒溫培養(yǎng)箱及某些必需的小型儀器。
●無(wú)菌操作間：專用于無(wú)菌操作、細(xì)胞培養(yǎng)。
大小要適當(dāng)，且其頂部不宜過(guò)高（不超過(guò)2.5m），以保證紫外線的有效滅菌效果；墻壁光滑無(wú)死角以便清潔和消毒；
工作臺(tái)安置不應(yīng)靠墻壁，臺(tái)面要光滑壓塑作表面，漆成白色或灰色以利于解剖組織及酚紅顯示pH的觀察。
孵育區(qū)——本區(qū)對(duì)無(wú)菌的要求雖不比無(wú)菌區(qū)嚴(yán)格，但仍需清潔無(wú)塵，因此也應(yīng)設(shè)置在干擾少而非來(lái)往穿行的區(qū)域。孵育可在孵箱或可控制溫度的溫室中進(jìn)行，后者費(fèi)用高，一般實(shí)驗(yàn)室多采用孵箱進(jìn)行工作。
儲(chǔ)藏區(qū)——主要存放各類冰箱、干燥箱、液氮罐、無(wú)菌培養(yǎng)液、培養(yǎng)瓶等，環(huán)境需要清潔無(wú)塵。
制備區(qū)——主要進(jìn)行培養(yǎng)液及有關(guān)培養(yǎng)用的液體等的制備。
清洗和消毒滅菌區(qū)——清潔和消毒滅菌區(qū)應(yīng)與其他區(qū)域分開(kāi)，主要進(jìn)行所有細(xì)胞培養(yǎng)器皿的清洗、準(zhǔn)備、消毒及三蒸水制備等工作。